Las técnicas de imagen han sido aplicadas en el diagnóstico de la endometriosis. Aunque tienen un valor limitado, son útiles para investigar la afectación de los ovarios, la vejiga, el colon, el espacio retroperitoneal y el tabique rectovaginal

La ultrasonografía transvaginal, que se utiliza de rutina en las clínicas de infertilidad, es capaz de diagnosticar endometriomas en los ovarios, vejiga y otras localizaciones con un alto grado de sensibilidad y especificidad, con una precisión diagnóstica del 90% . Sin embargo, no distingue lesiones más superficiales.

La RM tiene igualmente las limitaciones debidas al tamaño de los implantes y adhesiones, pero tiene la capacidad de caracterizar las lesiones y de estudiar localizaciones extraperitoneales. La pielografía i.v. o el enema baritado revelan la existencia de obstrucciones o constricciones en los uréteres o intestino