La Enoxaparina se obtiene por degradación alcalina del ester bencílico de la heparina obtenida de la mucosa intestinal porcina. Su estructura se caracteriza por un grupo de ácido 2-O-sulfo-4-enepiranosurónico en la terminación no reductora y por un grupo 2-N, 6-O-disulfo-D-glucosamina en el extremo reductor de la cadena. El producto final es una sal sódica. El peso molecular medio es de 4500 daltons. La distribución del peso molecular es