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Contador Web MANUAL DE INFORMACION MEDICA
 

ESTRATEGIAS DE BÚSQUEDAS DE INFORMACION MEDICA

 

INTRODUCCION

Como en todas las áreas del saber humano, los conocimientos médicos han experimentado en las últimas décadas un crecimiento exponencial. Algunos autores estiman que desde 1960, los conocimientos médicos se han duplicado cada 10 años, de manera que hoy día sabemos más de 30 veces más que nuestros colegas de hace 50 años.

Todos estos conocimientos se deben a la contribución de cientos de miles de profesionales que a lo largo de los años han ido entretejiendo hilo a hilo el vasto tejido de la Medicina. La gran mayoría de estas contribuciones fueron apareciendo en las revistas especializadas, las cuales obviamente, tuvieron que ir incrementando su número y su tamaño a lo largo de los años. Según la National Library of Medicina, en enero de 2008 había 5.246 publicaciones periódicas relacionadas con la biomedicina, de las cuales unas 350 se refieren a cardiología (ref.1)

Los libros de medicina indexados en amazon.com publicados en los últimos 4 o 5 años ascienden a más de 48.000. Si buscamos libros de cardiología, amazon.com nos permitía comprar en agosto de 2008, 19.919 libros (ref.2)

Para complicar (o según se mire, para mejorar la situación) en los últimos años, Internet se ha manifestado como una importante fuente de información médica, tanto para el médico como para el paciente. Aunque no se sabe el número exacto de "sitios" dedicados a la medicina, se estima que el número de páginas de Internet es de más de 6.000 millones (prácticamente una página para cada habitante del planeta) de las cuales varias decenas de miles deben de estar relacionadas con la medicina. Sin pretender haber sido exhaustivos, nosotros hemos tenido la oportunidad de evaluar a lo largo del año pasado unos 2500 sitios médicos en español, en su mayoría creados por Sociedades Médicas, Laboratorios Farmaceúticos y otras casas comerciales, hospitales, Instituciones estatales y de las Comunidades, universidades, etc). La parte positiva de Internet es que ofrece la posibilidad de acceder a una gran parte de la información médica existen desde cualquier parte del mundo, siempre que se disponga de una ordenador y de una conexión a Internet.

Por lo tanto, el problema que se presenta al profesional de la medicina no es que no exista la información que pueda necesitar en un momento dado, sino como acceder a ella de un modo rápido y eficiente y como separar el grano de la paja.

 

En lo que sigue haremos una revisión de las distintas fuentes de información y procuraremos mostrar como se accede a las mismas

Fuentes Información Médica

La información médica, independientemente de su soporte (papel, electrónico, discos, videos, congresos, etc), se pueden clasificar en términos generales en fuentes primarias y fuentes secundarias

Las fuentes primarias son las más abundantes: son fuentes primarias los artículos de las revistas, algunas de informaciones que aparecen en los periódicos especializados, los programas de radio, televisión, las conferencias transcritas a videopodcasts (para aquellos que no hayan visto nunca un videopodcast les mostramos uno), y la multitud de archivos textuales y gráficos que se pueden encontrar en Internet en los llamados Portales. También constituyen fuentes primarias, aquellos documentos que no siguen los canales habituales de publicación y difusión (Actas de Congresos, informes científicos, patentes, tesis doctorales, mesas redondas, etc).

En la práctica diaria, las fuentes primarias que puede necesitar el médico clínico o investigador son los artículos de las revistas y los documentos electrónicos equivalentes. Ocasionalmente, puede ser interesante recurrir a una base de datos iconográfica para resolver alguna duda relacionada con una imagen diagnóstica.

Teniendo en cuenta que el 90% de la información médica se localiza en fuentes primarias, se comprende que se hayan desarrollado herramientas para llevar a cabo las pesquisas necesarias. Esto es lo que se denomina búsquedas bibliográficas

 

Las fuentes secundarias son documentos en los que se selecciona y condensa las informaciones aparecidas en las fuentes primarias y, por lo tanto, no podrían existir sin las primeras. Son fuentes secundarias las bases de datos con los resúmenes de los artículos aparecidos en las revistas, los listados de las URLs de las Webs médicas de interés (por ejemplo los resultados de una búsqueda en los buscadores), los índices de las revistas médicas, los RSS (acrónimo de Rich Site Summary), etc.

Algunos ejemplos de este tipo de fuentes son la base de datos de PubMed (publicada por el National Health Institute) (Ref.3) , el Current Contents (publicado por el Institute for Scientific Information) o la base de datos Cochrane (Especializada en Medicina basada en la Evidencia). Algo más sofisticada es la Annotated Bibliography

En cuanto a los libros, podrían ser considerados como fronterizos entre fuentes primarias o secundarias. En la mayor parte de los casos, los libros de medicina los escriben autores con experiencia en el tema desarrollado, haciendo referencia a artículos de revistas publicados por ellos mismos o por otros colegas. Sin embargo, ocasionalmente en los libros se incluyen documentos no publicados con anterioridad, constituyendo entonces el libro una fuente primaria. Lo mismo puede decirse de los artículos de revisión (las "Reviews") que se publican en revistas y, que a nuestro juicio, constituyen una fuente muy valiosa de información.

Escenarios

Antes de pasar a la parte práctica de como llevar a cabo una búsqueda bibliografía, es necesario determinar que tipo de información es la que un médico necesita en un momento determinado y con qué fines. Obviamente, no es igual la información que el médico desea ofrecer a su paciente en su consulta, que la que él mismo desea consultar en casos de duda con un diagnóstico o tratamiento. También es diferente la información que necesita un investigador implicado en nuevas áreas biomédicas, la que necesita un autor que está escribiendo un artículo o la que necesita un inventor de un nuevo dispositivo o tratamiento para comprobar si su "invento" puede ser o no objeto de una patente.

De esta manera, podemos imaginar tres o cuatro escenarios diferentes:

1.- Profesional que desea hacer llegar a su paciente una información adecuada y asequible para el mismo (Por ejemplo un plan dietético o de ejercicios para un paciente que ha experimentado un infarto de miocardio)

2.- Profesional que desea aclarar alguna duda relacionada con un diagnóstico o tratamiento. En este caso, podemos diferenciar la información que necesita un médico de atención primaria, de la de un especialista. Mientras que para el primero puede ser suficiente una revisión sobre el tema, el segundo puede necesitar información sobre los avances mas recientes publicados sobre dicho tema. Por ejemplo, el médico de atención primaria puede necesitar recordar que medicamentos presentan interacciones con la estatina que ha prescrito a su paciente hipercolesterolémico. O también puede interesarle consultar una guía de Práctica Clínica.

Por su parte, el especialista puede necesitar hacer una revisión sobre los resultados a largo plazo de los stents medicados (¿que medicamento?) a su paciente cuya coronaria va a ser dilatada.

3. - Profesional implicado en una investigación ya sea clínica o básica: para este profesional, será necesaria una información que incluya todos los datos disponibles sobre el tema de su investigación. Por ejemplo, un investigador implicado en un estudio clínico con un nuevo fármaco, necesitará no solo la información facilitada por el Laboratorio, sino toda la información sobre estudios realizados con fármacos similares.

4.-Inventores: deberán documentarse sobre la originalidad de su invento en las bases de datos de patentes y/o en las bases de datos de productos químicos y bioquímicos (p.ej. el Chemical Abstract)

5.- Finalmente, no podemos descartar como usuarios potenciales de la información médica los estudiantes de Medicina y otras diplomaturas sanitarias. Ellos requerirán una información fácil de asimilar y de recordar

Terminología

Referencia Bibliográfica: constituye algo así como las coordenadas de una publicación, y permite localizar inequívocamente un artículo de una revista o un capítulo o un fragmento del mismo en un libro. Para ello, se utilizan unas normas especiales, introducidas en 1979 un grupo de editores reunidos en Vancouver. Este grupo, llamado de Vancouver, se convirtió posteriormente en el Comité Internacional de Editores de Revistas Médicas (ICMJE) y sus directrices adoptadas como estándar por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) de los EE.UU.

Para los autores, existen directrices de como deben incluirse en los artículos las referencias bibliográficas e, incluso, citas textuales incluídas en el cuerpo de artículo. Esras directrices, que constituyen el llamado estilo MLA (estilo de la Modern Language Association) pueden ser fácilmente localizadas en INTERNET

Una referencia bibliográfica de un artículo de revista publicado sobre papel debe llevar necesariamente las siguientes informaciones:

  • Nombre completo del autor o autores: primer apellido, seguido del nombre o de las iniciales del mismo (p.ejemplo, Mironneau, J., Lepretre, N., Arnaudeau, S., Rakoroarisoa, L., Galiano, A.)
  • Título del artículo completo (p.ej.: Electrophysiological and radioligand binding studies of Elgodipine and derivatives in portal vein myocytes.
  • Nombre de la Revista: se admiten los nombres completo of sus abreviaturas . Por e.j Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics o también J.Pharm.Exp.Ther
  • Año de la Publicación: (1994)
  • Volumen y número (este último entre paréntesis: 271 (3)
  • Primera y última páginas: : 1209-1215.

La referencia bibliográfica de un capítulo o parte del mismo debe llevar la siguiente información

  • Nombre completo del autor o autores (igual que en el caso de una revista). P.ej. Asplin, J.R, Coe F.L, Favus. M.J.
  • Título completo del capitulo: Nephrolithiasis
  • Título del libro en el que se encuentra el capítulo: p.ej. Principles of Internal Medicine
  • Editor y número de la edición: Harrison, 15 th Ed
  • Año de la Edición: 2001
  • Editorial: p.ej. McGraw-Hill
  • Lugar de la publicación (en este caso no es aplicable ya que la editorial McGraw tiene múltiples sedes sociales)
  • Capítulo: p.ej. cap. 279
  • Primera y última páginas: p.ej. 1615-1620

Adicionalmente, otras informaciones menos frecuentes que pueden ser añadidas por un autor en su artículo incluyen Comunicaciones a Congresos, Posters, Cartas o documentos privados. Los formatos en los que se deben citar pueden verse aquí

URL: URL significa Uniform Resource Locator, es decir, localizador uniforme de recurso. Es una secuencia de caracteres, de acuerdo a un formato estándar, que se usa para nombrar recursos, como documentos e imágenes en Internet, por su localización. En otras palabras, sirve para localizar un archivo, del tipo que sea, que se encuentra en el disco duro de una máquina conectada a Internet.

El formato de una URL es, por regla general el siguiente:

  • - Protocolo de comunicación que utiliza nuestro ordenador para comunicarse con el ordenador remoto en el que encuentra el archivo, seguido de ://. Por ej. http:// (iniciales de Hypertext Transfer Protocol) o ftp:// (iniciales de File Transfer Protocol)
  • - Dominio: es el nombre (usualmente registrado) de la máquina en la que se encuentra el archivo, seguido de un punto y una extensión (p.ej. www.iqb.es). Las extensiones mas utilizadas se refieren al país (es = España; uk= Reino Unido; it: Italia) o al hecho de que la máquina pertenezca a una organización comercial (.com), una organización (org), una institución educativa (.edu) o gubernamental (.gov), etc.
  • Ruta del Archivo en el servidor: p.ej., la ruta del presente documento es: http://www.iqb.es/monografia/fichas/ficha089.htm

La URL es suficiente para localizar un documento de INTERNET, pero lo mismo que ocurre en el caso de los artículos de revistas o libros, la NLM ha publicado en el 2001 unas directrices sobre la inclusión de las referencias bibliográficas en un texto electrónico que incluyen varios campos más. Para los lectores interesados, estas directrices se pueden encontrar aquí

Tesauro: En el campo de la biomedicina, un tesauro es una lista que contiene los "términos" empleados para representar los conceptos, temas o contenidos de los documentos, con miras a efectuar una normalización terminólogica que permita mejorar el canal de acceso y comunicación entre los usuarios y las Unidades de Información. En Medicina y en Inglés, el más conocido es el MeSH (Medical Suject Headings) por ser el utilizado por la más importante base de datos bibliográficos, PubMed de la National Library of Medicine.

 

Bases de datos: son sistemas que organizan, clasifican y almacen a documentos. Inicialmente las bases de datos utilizaban fichas (o registros) en las que se guardaban los datos en diferentes campos (p.e. autor, revista, año, editor, etc), pero hoy día todos los documentos se encuentran en formato electrónico y son accesibles por ordenador mediante un sistema interactivo. Las bases de datos de referencias bilbliográficas contienen además de las "coordenadas" del documento buscado, un resumen del artículo referenciado (el "abstract"). Algunas bases de datos pueden contener además comentarios, o enlaces a otros artículos relacionados (p.ej.la base de datos Clinical Knowledge Summaries ). Incluso algunas editoriales han creado bases de datos con sus publicaciones que permiten buscar una determinada información en todas la revistas de la editorial. Por ejemplo, la base de datos ScienceDirect, creada por la Editorial Elsevier (http://www.sciencedirect.com/) permite obtener toda la información publicada en alguna revista de la editorial. Por ejemplo, al buscar por el término "Elgodipine" el sistema nos devuelve 11 resultados que podemos revisar. La ventaja de una base de datos de este tipo es que si a partir del abstracto vemos que el artículo nos interesa, podemos comprarlo On-line (aunque suelen ser muy caros)

Aunque existen miles de bases de datos creadas por Instituciones y Universidades, nos referiremos sólo a aquellas que son accesibles a través de Internet.

RSS: un sencillo formato de datos que es utilizado para redifundir contenidos a suscriptores de un sitio web. El formato permite distribuir contenido sin necesidad de un navegador, utilizando un software diseñado para leer estos contenidos. Este servicio es interesante ya que el suscriptor recibe periodicamente información sobre el tema o temas seleccionados. Un ejemplo de distribuidor de RSS en cardiología puede encontrarse aquí. Los contenidos distribuídos por esta vía pueden ser de cualquier tipo, incluyendo podcasts y videopodcasts

BUSQUEDA DE INFORMACION BIBLIOGRÁFICA

En el librito que les ha sido facilitado, se describen algunas bases de datos gratuitas en inglés (Pubmed, Scirus, Google Academico, etc) y en español. También se describen algunas bases de datos de acceso restringido. Sin embargo, a nuestro juicio, para disponer de una información secundaria exhaustiva son suficientes Medline y Google (o su variante Google Academics) (y eventualmente si estamos muy interesados en Medicina basada en la Evidencia, la base de datos de Cochrane)

 

MEDLINE.

Medline es una base de datos desarrollada a partir de 1950 por la NLM (Biblioteca Nacional de Medicina) del Instituto Nacional de la Salud (NHI) de los EE.UU. Antes de la llegada de Internet, MEDLINE consistía en listados de referencias bibliográficas organizadas por palabras clave (del MeSH). Estos listados o índices tenían un periodicidad mensual y se publicaban como "Index Medicus". Nosotros estuvimos suscritos al Index Medicus en la década de los 70, recibiendo cada mes uno o dos tomos del tamaño de una guía telefónica.

Por ejemplo, la información sobre un término determinado (p.ej.salbutamol) aparecía en cada uno de los siguientes términos: salbutamol, broncodilatador, asma, agente b-adrenérgico, etc) de manera que el título del artículo podía aparecer en varios sitios. Obviamente por razones de espacio, sólo figuraban los autores, el titulo del artículo y la revista (con año, número y páginas)

Cuando los ordenadores se popularizaron (hacia comienzos de la década de los 80), Medline fue digitalizada, siendo asequible en formato de base de datos electrónica en Instituciones tales como DIALOG (Ubicada en Palo Alto, California), DIMDI (Deutschen Institut für Medizinische Dokumentation und Information, Alemania) o ESA (Italia). Al no existir todavía INTERNET, se requerían sistemas de comunicación especiales para realizar las consultas. En España, era el Ministerio del Ejército conjuntamente con Telefónica, quien proveía de la linea de comunicación (denominada TRANSPAC) que funcionaba entonces a 300 baudios (10.000 veces más lenta que una línea de ADSL de hoy). El coste de las comunicaciones era tan elevado que los documentos que se obtenían en una busqueda no eran "bajados" sino que se solicitaba al servidor remoto que imprimiese los abstracts y los enviase por correo normal.

A finales de los 80, con la aparición de los CD-ROMS de datos, MEDLINE fue ya asequible a los particulares aunque su coste (unas 300.000 pesetas de 1990/año) solo era asumible por empresas. Una importante ventaja de los CD-Roms es que utilizaban los operadores boleanos (ver mas adelante) para la recuperación más rápida y completa de la información. Ademas, se incluían ya los abtracts de cada uno de los artículos referenciados.

Finalmente, INTERNET a partir de mediados de los 90 ha permitido poner al alcance del profesional de la medicina y del publico en general MEDLINE siendo un servicio gratuito que permite el acceso a más de 25 millones de referencias bibliográficas relacionadas con la Medicina

MEDLINE se consulta desde PubMed. Sin embargo si entramos en esta página, veremos que Pubmed se integra con otras bases de datos. Para los médicos, además de Pubmed puede ser interesante OMIM y PubMed Central (PMC). OMIM es una base de datos dentro de otra base de datos y se refiere a las enfermedades genéticas. En ella, se describen más de 6.000 enfermedades y síndromes con todos los sinónimos y epónimos, así como las mutaciones genéticas responsables. Por su parte, Pubmed Central tiene el interés de que contienen artículos de revista a texto completo (en formato PDF). Como veremos más adelante al discutir la estrategia de una búsqueda, no siempre es fácil encontrar el artículo que necesitamos a texto completo.

El principal inconveniente de PubMed es que utiliza el inglés tanto para la búsqueda por palabra clave como en los resultados que se obtienen. Esto puede ser un serio inconveniente si se ignora el término inglés. Por ejemplo, si deseamos información sobre "rotura de bazo" dificilmente podremos hacerlo si ignoramos que bazo en inglés es "spleen ". Afortunadamente, en este caso INTERNET y sus buscadores como Google vienen un nuestra ayuda. Si buscamos en Google "rotura de bazo" es casi seguro que encontraremos una monografía o artículo en cuya bibliografía o abstracto aparezca el término en ingles. Alternativamente, podemos ir al término "Rotura de bazo" en Medciclopedia, encontrándose alli la traducción. Otra opción es consultar los descriptores de Ciencias de la Salud de Bireme, una base de datos brasileña que reúne los términos médicos en español y portugués

En el caso de que los resultados que nos ofrezcan Google o Yahoo acerca de un término sean demasiados, siempre podemos recurrir a un buscador médico específico, por ejemplo en www.searchmedica.es.

Estrategia para llevar a cabo una búsqueda con éxito.

En general, todas las bases de datos funcionan de una manera parecida, por lo que dedicaremos una buena parte de esta exposición a Pubmed (por ser la más completa)

Primera búsqueda en Pubmed

Vamos a realizar una búsqueda sencilla, por ejemplo "rotura de bazo". En la caja de búsqueda, escribimos la frase completa "spleen rupture" y pinchamos el botón GO. El sistema nos devuelve una página con 4700 referencias. Obsérvese que, por defecto, de todas las bases de datos disponibles que aparecen en el menú desplegable, el sistema ha utilizado Pubmed.

Para ver como el sistema ha interpretado nuestra búsqueda, pinchamos la pestaña "details". En la caja de estrategia de la búsqueda aparecen todos los términos que ha utilizado Pubmed. Ha ocurrido que Pubmed ha realizado un mapeo automático de los términos señalados indicando todos los términos que ha empleado y los operadores boleanos que ha utilizado para realizar la búsqueda.

Para ver con más detalle como hace PUBMED un mapeo automático de los términos, buscaremos información sobre "causas de las hemorragias nasales", en inglés "nose bleeding causes". El sistema nos devuelve todas las referencias. Si pinchamos la pestaña Details, nos aparecen todos los términos y las boleanas que Pubmed ha utilizado para la búsqueda

Antes de seguir adelante, explicaremos lo que son las operaciones lógicas y los llamados operadores boleanos. Este último término procede de las Matemáticas de los Conjuntos: en efecto, los artículos bibliográficos constituyen conjuntos, definidos por la palabra clave. Como se señala en el ejemplo del librito, los las citas relacionadas con cáncer forman un conjunto y todas las relacionadas con pulmón otro. Utilizando los operadores boleados AND, OR y NOT (se utilizan mayúsculas) la base de datos restringe los resultados como muestran los gráficos.
  Si queremos que Pubmed haga la búsqueda ateniéndose exclusivamente a la frase seleccionada, debemos escribirla entre comillas. En este caso, el sistema no hace el mapeo automático de los términos por lo que que nos devuelve menos resultados.

Como se presentan las referencias

Pubmed devuelve las referencias a razón de 20 por página, si bien podemos pedir que las muestre desde 5 a 500 por página. Además, podemos pedir que las ordene de varias maneras. También podemos pedir que las envíe a distintos sitios, por ejemplo a un archivo de texto si las vamos emplear en una monografía o artículo, o a la impresora

Otros aspectos (aunque no todos) interesantes de esta página de resultados son:

  • un cuadro para seleccionar la referencia
  • la existencia de un abstracto o un enlace a un artículo disponible a texto completo
  • artículos relacionados, etc

 

Buscando por título

Si conocemos el título de la cita que buscamos, total o parcialmente, podemos pedirle a Pubmed que se limite a buscar las referencias que contengan el término señalado en el título. Por ejemplo, en el pasado tuve la oportunidad de dirigir un proyecto de I+D sobre un antagonista del calcio, la Oxodipina. Para ver las referencias que existen sobre oxipina en Pubmed, basta con escribir en la caja de diálogo: Oxodipine [Ti]. El sistema devuelve 24 referencias y, si pinchamos "Details" vemos que ha utilizado el término oxodipine como título.

Vamos a aprovechar para ver como podemos limitar los resultados devueltos de acuerdo con nuestras necesidades. Supongamos que de las 24 publicaciones sólo nos interesan estudios en animales. Vamos a Advanced Search y ticamos "animals". El sistema nos devuelve 22 resultados. ¿En cuales de estos estudios tuve yo mismo la ocasión de participar?. Sencillamente en la página de busqueda avanzada, ademas de ticar animales, escribimos Galiano en la caja de búsqueda por autores (Aunque el sistema nos propone varios Galianos, no es necesario elegir uno). El sistema devuelve 10 resultados, justamente los estudios en los que participé

Una interesante opción adicional de PUBMED es la posibilidad de utilizar el título en idioma original haciendo una búsqueda por el Transliterated Title. Lo mismo que antes, basta con conocer alguna de las palabras del título y escribir entre corchetes [TT]

 

Buscando por autor

Para hacer una búsqueda por autor en Pubmed basta con introducir el apellido del autor y sus iniciales en la caja de búsqueda. Por ejemplo, el apellido de un servidor Galiano A. En mi caso, no hay una segunda inicial. Al pinchar GO, el sistema devuelve todas las referencias en las que aparece mi nombre. Obsérvese que no importa el ranking que haya ocupado en la lista de autores. Tampoco importa que mi nombre se escriba en minúsculas o mayúsculas. Por otra parte, a partir del 2002 se puede buscar por el nombre completo, pero solo sí el mismo aparece en la publicación original. Articulo del IQB

Para buscar por múltiples autores, se introducen sus apellidos e iniciales en la caja de búsqueda, por ejemplo Lahiri A, Galiano A: como estos autores solo tienen una referencia conjunta, el sistema manda directamente al abstract. Obsérvese que si no se saben las iniciales de alguno de los autores, puede que no sean necesarias como ocurre en este caso.

Pero si un autor tiene un apellido que puede confundirse con un término de MESH, entonces hay que añadir entre paréntesis [au] Por ejemplo "Head" que además de apellido es un término de MESH

Finalmente cuando puede existir una confusión entre el nombre y el apellido es necesario escribir primero el apellido seguido de una coma, y luego el nombre (p. ej, James -apellido- Stuart -nombre)

Buscando por revista

Se puede buscar una revista determinada escribiendo en la caja de búsqueda el nombre completo de la revista o la abreviatura que utiliza MEDLINE. Eventualmente se puede utilizar el ISSN (iniciales de International Standard Serial Number)i, si se conoce. Por ejemplo, American Journal of Cardiology puede buscarse como tal o como Am J Cardiol.

En el caso de que el título de la revista coincida con un término de MESH, es necesario añadir entre corchetes [ta]. Obsérvese en el ejemplo que Pubmed devuelve todos las revistas en las que se incluye el término "cardiology"

Para buscar una referencia determinada, Pubmed dispone de una herramienta particular llamada "Single Citation Matcher" (o sea "buscador de referencias únicas ") que aparece en el menú de la izquierda de la página de entrada de Pubmed. Rellenando algunos de los campos de esta caja de búsqueda podemos encontrar rápidamente la referencia buscada. Evidentemente, cuantos más campos de rellenen, mas específico será el resultado de la búsqueda.

Si no recordamos con exactitud el nombre de la revista, Pubmed dispone de una base de datos de Journals, en la que se puede buscar utilizando, como siempre, la caja de búsqueda. Por ejemplo, buscaremos toda la información sobre la revista Acta anesth Scand. Seleccionamos Journals Database en la columna de la izquierda y en la caja de búsqueda escribimos la abreviatura de la revista. Al pinchar en GO, el sistema nos devuelve una página con toda la información acerca del Acta Anaesthesiologica Scandinavica. Si pinchamos links a la derecha de la pantalla, aparece un menú desplegable que nos ofrece la posibilidad de buscar en varias bases de datos o de utilizar el Single Citation Matcher. Al seleccionar esta última opción el sistema nos envía a la caja de búsqueda donde ya aparece la revista. Si rellenamos el campo "autor" con Galiano A, el sistema nos envía a la misma referencia que habíamos visto anteriormente.

 

 

 

 

Complicando la búsqueda

Utilizando limites

Con frecuencia, los resultados de una búsqueda son tan numerosos que no es práctico leerlos en su totalidad. Pubmed dispone de una herramienta "Limits" para limitar por campos los resultados:

Algunos de estos campos son

  • Fecha: se pueden solicitar referencias publicadas en un período de tiempo determinado
  • Texto libre
  • Autor
  • Revista
  • Idioma
  • Tipo de artículo, etc, etc

Por ejemplo, volvamos al ejemplo "spleen rupture", pero lo que nos interesa en este caso son las rupturas de bazo en los niños en edad pre-escolar. Al realizar la búsqueda por "spleen rupture" nos aparecen más de 4000 referencias. Utilizamos entonces la opción "Limits": el sistema va a una página en la que se nos ofrece una multitud de opciones. Ticamos la caja de edad apropiada y pinchamos en GO. El sistema nos devuelve 321 referencias.

Podemos limitar aún más los resultados, utilizando de nuevo "Limits" y seleccionando otro limitador, por ejemplo Review. En este caso, el sistema nos devuelve ya tan solo 21 referencias

En este momento pueden presentarse 3 opciones:

  • Alguna(s) de las referencias conseguidas pueden ser las que nos interesan
  • Ninguna referencia es adecuada
  • Alguna referencia podría ser la adecuada, pero tendriamos que saber algo más

Para estas tesituras, PUBMED nos presenta alguna herramientas.

1º Para saber si los resultados son satisfactorios podemos ir al abstract que nos dá una pista acerca de su contenido. Además, en cada una de las páginas de abstracts, hay un enlace "related articles" cuyo título puede ser sugerente. Pinchando en cada articulo, llegamos al correspondiente abstract que igualmente, tiene un enlace "related links"

2º Ninguna referencia es adecuada. Podemos bien repetir la búsqueda truncando el término, utilizar otro término, utilizar dos términos con los operadores boleanos AND y OR y bien utilizar la base de datos MESH, lo que veremos más adelante

El truncado permite recuperar todos los términos que poseen la misma raíz. Si colocamos un asterisco (*) al final de un término de búsqueda, Pubmed busca en todas aquellas palabras que tengan la misma raíz. Por ejemplo, si escribimos gastros*, se incluyen en la búsqueda todos los términos que pueden verse al pinchar "details"

Obviamente, si truncamos despues (p.ej. "gastrosc*") la búsqueda se reduce y si truncamos antes (p.e. gastro*) se amplia la búsqueda. Obsérvese que hay tantos términos con la raíz "gastro" que Pubmed señala que sólo ha utilizado los 600 primeros

 

Buscando por sustancias

La búsqueda en Pubmed de medicamentos o de sustancias químicas o biológicas es muy sencilla. Basta introducir en la caja de busqueda el nombre genérico de la sustancia, p.ej. atorvastina, y el sistema nos devuelve todas las referencias que tiene en la base de datos. Si estuvieramos interesados en conocer el nombre comercial de la atorvastatina o las denominaciones del laboratorio antes de obtener el INN (International Non-Propietary Name) es preferible comenzar la búsqueda desde la base de datos MESH. Podemos ver que la página de MESH nos dá el nombre comercial, y los distintos sinónimos de la atorvastatina

 

 

Estrategia de búsqueda con la base de datos MESH

La base de datos MESH (Descriptores de Ciencias de la Salud) es un vocabulario controlado de términos biomédicos que identifican el contenido de cada artículo en la base de datos de Medline. En otras palabras, es el diccionario de términos médicos utilizados por PubMed

Mesh contiene unos 35.000 términos que son revisados cada año para reflejar los cambios y adiciones en la terminología médica.

La ventaja de buscar en la base de datos MESH es que se pueden ver los términos ordenados en una estructura jerárquica a partir de 15 grandes categorias. Se pueden seleccionar los términos MESH para búsquedas con operadores boleanos, o limitar la busqueda un concepto mayor (tema principal). Los descriptores MESH pueden ser utilizados con subencabezamientos ("subheadings") que permiten concretar algunos aspectos específicos del término

 

Primera busqueda en MESH

El primer paso, es definir exactamente que información deseamos buscar, por ejemplo "efectos secundarios y mortalidad de los stents medicados"

El paso siguiente es decidir la(s) palabra(s) clave que utilizaremos, asegurándonos de que están presentes en MeSH. En este caso, utilizamos la palabra clave "stent" y desde la página de entrada de MeSH buscamos si se encuentra el término stent. El sistema nos devuelve una página con 2 resultados: Stents y Drug-Eluting Stents. Como lo que nos interesa son los stents medicados (en este caso ni siquiera nos ha hecho falta saber como se dice en inglés "stents medicados) y pinchamos GO

  • El sistema nos devuelve una página con dos entradas. Obsérvese que el sistema nos dá la definición de los dos términos
  • Estudiemos el término "Drug-Eluting stents". Si pinchamos el enlace links, aparece un menu desplegable que nos permite elegir entre varias opciones :
    • si deseamos buscar en toda la base de datos
    • solo en los artículos que se refieren como tema principal a stents medicados
    • artículos sobre estudios clínicos.

Si seleccionamos Pubmed nos aparecen más de 546 artículos. Cuando los stents medicados son el tema principal solo aparecen mas de 400, demasiados aún para verlos uno por uno.

  • Por este motivo, volvemos atrás, seleccionamos la caja que hay a la izquierda y le decimos al sistema que mande este término a la caja de busqueda utilizando como operador Boleano AND
    Podemos ver que en la caja de búsqueda aparece el "Drug Eluting Stents" y que este término pertenece al tesauro MESH.
  • Repetimos la busqueda escribiendo mortality en la caja de búsqueda. Obsérvese que seguimos dentro de la base de datos MESH y que el sistema nos ofrece varias posibilidades. Seleccionamos "mortality" y lo mismo que antes le decimos que mande este término a la caja de búsqueda con el operador AND.
  • Finalmente, repetimos los mismos pasos con el término "side effects". A la finalización de estos pasos, tendremos definida nuestra búsqueda. Solo falta decirle al sistema que lo busque en Pubmed: se obienen 14 referencias, de las cuales 2 son revisiones

Por este motivo, hemos seleccionado en el ejemplo que estamos desarrollando el operador AND.

 

 

 

Complicando la búsqueda

MESH facilita las búsquedas al establecer una jerarquía. Por ejemplo supongamos que deseamos saber las "causas de pericarditis". Si en la base de datos MESH buscamos por pericarditis, nos aparecen tres términos principales, con sus correspondientes definiciones. Pinchamos en Pericarditis. El sistema nos devuelve una página compleja en la que aparecen subencabezamientos, y al final de la página, la posición de pericarditis dentro de la jerarquía de MESH. Por debajo de Pericarditis, aparecen dos términos más específicos, mientras que por encima términos más generales. Si, por ejemplo estamos interesados en pericarditis constrictiva, no será buena idea utilizar el término pericarditis que al ser más general, nos devolverá más resultados.

Obsérvese que cuando Pubmed busca un término (en este caso pericarditis) también busca en los términos situados jerárquicamente por debajo del mismo (en este caso, pericarditis constrictiva y pericarditis tuberculosa). Esta operación se denomina "Explotar el término" y se lleva a cabo siempre que no se solicite expresamente que no lo haga (ticando en la caja "do not explode this term".)

Por el contrario podemos limitar la amplitud de la búsqueda, ticando la caja "limitar artículos en los que el término seleccionado es el mayor" . En el ejemplo que estamos desarrollando, vamos a hacer una búsqueda con varios términos, por lo que ticamos la caja "Restrict Search to Major topics". En la caja de búsqueda elegimos la opción "Search box with AND"... y vemos que en la caja de busqueda aparece "pericarditis [majr]

El siguiente término que añadimos es "causes". En Mesh aparecen tres términos. Al pinchar "causality" Pubmed nos devuelve la página con los correspondientes subencabezamientos y la posición de causality dentro de la jerarquía. Los subencabezamientos describen una amplia variedad de aspectos que pueden encontrarse en los artículos por lo que seleccionando uno o varios de ellos, podemos restringir la búsqueda


Reduciendo el tiempo de búsqueda

PubMed dispone de dos herramientas que nos permiten acortar el tiempo de búsqueda. La opción "Preview" permite visualizar el número de artículos que nos devolverá la búsqueda por lo que, si son demasiados, podremos ir refinándola

Supongamos que deseamos información sobre el herpes zoster oftálmico y su tratamiento con valaciclovir y corticoides. Abrimos la pestaña Preview/index y, en la caja de búsqueda escribimos "Ophthalmic herpes zoster". Al picar "Preview" el sistema nos dice que tiene 1243 referencias. Seguidamente, en la misma caja de búsqueda escribimos con la boleana AND el termino valacyclovir y de nuevo, la boleana AND y el término Glucocorticoids. Las 1243 referencias se han reducido a 7 que modemos visualizar bien desde la columna de los resultados, bien haciendo "Go"

El índice funciona de una manera similar al de un libro. Por ejemplo, una vez definido el o los términos de búsqueda, por ejemplo "Ophthalmic herpes zoster" se introduce este texto en la caja de búsqueda en la parte inferior de la pantalla y se pincha el botón "Index". Se abre un caja en la que el sistema nos ofrece, por orden alfabético todos los términos con los que se puede combinar. Se elige una boleana, por ejemplo AND y uno de los términos desplegados, por ejemplo, "ophthamic infection" y se pincha "preview". El sistema nos señala que existe un resultado relativo a las infecciones oftálmicas que pueden producirse el herpes zoster oftálmico

 

Pubmed tiene memoria

Pubmed guarda en su memoria las búsquedas más recientes que hagamos en una o varias sesiones siempre que no transcurran más de 8 horas. Las busquedas efectuadas en este tiempo pueden verse pinchando la pestaña Preview/index. Además, las búsquedas almacenadas en la memoria se pueden combinar para hacer búsquedas complejas. En este sentido, Preview/Index funciona como la historia

Utilizando el historial de búsquedas

PUBMED guarda las búsquedas realizadas, de manera que al final de las mismas, se pueden seleccionar una o más de las historias y combinarlas para llevar a cabo una búsqueda más compleja

Al pinchar en la pestaña de History, el sistema nos advierte que nuestra historia se perderá después de 8 horas de inactividad y muestra otras opciones para hacer busquedas complejas y guardar las historias

Aprovechando los recursos de PUBMED. "My NCBI"

Si estamos interesados en un tema en particular, Pubmed nos permite guardar en su base de datos nuestra búsqueda, y nos ofrece otros interesantes servicios

El NCBI es un acrónimo National Center for Biotecnology Informatics, una division de la
National Library of Medicine (NLM) en el National Institute of Health (NIH). Inicialmente creada para buscar en bases de datos de genes y proteínas y otras de las bases de datos del NLM, su uso ha sido también ampliado a Pubmed.

Para usar My NCBI hay que registrarse creando una cuenta, aunque es gratuita. El sistema pide un nombre de usuario y una contraseña que se puede guardar en la memoria.

Veamos como funciona My NCBI. Lo primero que tenemos que hacer es registrarnos rellenando los formularios que nos presenta el sistema. Obsérvese que el navegador que se utilice debe admitir las "cookies". Observese también que My NCBI posee herramientas para mantenerse alojado (solo cuando se utiliza un ordenador propio), cambiar de contraseña, etc. Al registrarse el sistema crea una carpeta personal en la que se pueden guardar estrategias de búsquedas, colecciones de referencias, etc

Realicemos ahora una búsqueda en Pubmed, por ejemplo "terapia de la hipercolesterolemia familiar" .En la caja de búsqueda introducimos "familial hypercholesterolemia drug therapy" y el sistema nos devuelve la página de resultados. Si estamos satisfechos con los resultados, salvamos la búsqueda. Por defecto, la búsqueda se salva con las palabras utilizadas, pero si se desea, se puede cambiar. Además, el sistema nos pregunta si queremos recibir un correo electrónico cuando se publique algun artículo sobre el tema elegido. Si elegimos esta opción, el sistema nos ofrece varias posibilidades: frecuencia, formato, número de citas, etc. Un correo electrónico de PUBMED alertando sobre una nueva publicación relativa a la rotura de bazo puede verse aquí

Para ver las búsquedas que hemos guardado, se pincha "my NCBI". En este cuadro podemos cambiar algunos de los parámetros. También podemos ver nuestras búsquedas antiguas y modificarlas si así lo deseamos. Por ejemplo, además de "familial hypercholesterolemia drug therapy" podemos añadir AND diet

 

Los filtros de my NCBI permiten limitar el número de respuestas para que el sistema nos señale sólo aquellos artículos en los que estemos realmente interesados. Por defecto, PUBMED utiliza el filtro de "Reviews". Pero también podemos añadir nuestros filtros pinchando el icono de herramientas. Nos aparece un cuadro de opciones en el que podemos elegir si queremos que sean estudios clínicos, artículos a texto completo, etc. Se pueden aplicar hasta 5 filtros. Si vemos que uno de los filtros es el más adecuado, podemos salvar la estrategia de búsqueda, pinchando la chincheta que aparece en la pestaña.

Además de los filtros que ofrece PUBMED en "My NCBI" podemos seleccionar más filtros, pinchando la pestaña de "Browse" .

My NCBI nos permite también guardar en nuestra carpeta personal una colección de referencias bibliográficas para su uso futuro (p.ej. para escribir un artículo o una tesis). Como puede verse, en nuestra carpeta se guardan las estrategias de búsqueda y las colecciones.

My NCBI nos permite crear sistema de alerta sobre reacciones adversas de un fármaco o familia de fármacos. El primer paso es hacer una búsqueda en PUBMED, por ejemplo "statins adverse effects" utilizando "Limits" si fuese necesario. Una vez satisfechos con loa resultados, salvamos la búsqueda en nuestra carpeta de my NCBI. El sistema nos pregunta si queremos que nos alerte mediante un correo electrónico y, si decimos afirmativo, nos permite toda una serie de opciones

OBTENCION DE LOS ARTÍCULOS A TEXTO COMPLETO.

Ya hemos visto que la NLM tiene una base de datos llamada PUBMED CENTRAL que contiene artículos a texto completo que pueden satisfacer nuestras necesidades. Por ello, recomendamos que en la página de resultados de una búsqueda en PUBMED o en MESH, busquemos los iconos o que nos remitirán a los artículos completos

Problemas

APLICANDO LO QUE HEMOS APRENDIDO

Se muestran algunas estrategias de búsqueda para responder a preguntas concretas

Biblioteca Virtual de la OMC

Si estos artículos no son suficientes, podemos recurrir a la biblioteca virtual de la OMC (Organización Médica Colegial), que tiene un servicio gratuito para todos los médicos colegiados. Para tener acceso a esta base datos, hay que solicitar un identificador de usuario y una contraseña a www.galenics.com. Este servicio debe contratarse a través del Servicio en el que trabaja el médico.

La estrategia de búsqueda en la biblioteca virtual de la OMC es parecida la de PUBMED. La primera página nos señala una serie de bases de datos. Usualmente se seleccionan las tres primeras, y al continuar nos llega una página compleja con numerosos campos. Si deseamos artículos a texto completo es necesario ticar la correspondiente caja. En este caso de "spleen rupture" el sistema nos devuelve 4 artículos a texto completo.

La ventaja que puede tener la biblioteca virtual de la OMC es que dispone de una base de datos en español (Medicina Latina, EBSCO) en la cual podemos buscar con términos españoles

 

BIBLIOTECA VIRTUAL LAÍN ENTRALGO

La Comunidad de Madrid ha puesto a disposición de los médicos inscritos en el Sistema de Salud de la Comunidad una biblioteca Virtual a la que se puede acceder On-Line y consultar numerosas revistas que contienen artículos a texto completo. Solo pueden acceder los médicos de Madrid, aunque otras Comunidades ofrecen servicios parecidos. Por ejemplo en Andalucía existe una biblioteca virtual que probablemente ofrecerá servicios similares a los de la Laín Entralgo.

 

PETICION DE SEPARATA

Una fórmula muy económica para conseguir un artículo a texto completo es pedirle una separata al autor. En general, cuando un autor publica en una revista, el editor le suministra unas 50 separatas sobre papel. Se puede localizar con cierta facilidad la dirección postal del centro al que pertenece el autor y se le puede escribir una postal (la forma más económica del correo tradicional) solicitando que nos mande una separata de su trabajo, mediante una fórmula como la siguiente:

Dear colleague:

We would appreciate receiving a reprint of your work "Late stent thrombosis after drug-eluting stent implantation for acute myocardial infarction: a new red flag is raised." Circulation. 2008 Sep 9;118(11):1117-9."

Best regards

Algunas compañías facilitan incluso tarjetas preimpresas para que sólo haya que copiar y pegar los datos necesarios, con una pegatina con la dirección postal del remitente para facilitar al autor el envío de la separata.

Otra alternativa es obtener la dirección electrónica del autor y mandarle un e-mail en los mismos términos

En nuestra experiencia, alrededor del 50% de los autores contesta. Incluso, si han agotado las separatas facilitadas por el editor, mandan fotocopias.

Finalmente, si todo lo anterior falla, podemos ir a una biblioteca de un hospital para fotocopiar el artículo o eventualmente comprarlo al editor (aunque su costo suele ser muy elevado)

 

COCHRANE

La biblioteca Cochrane es una base de datos que ha sido traducida parcialmente al español y puesta a disposición de la clase médica por el Ministerio de Sanidad y consumo. El acceso universal gratuito a la BCP, en todo el territorio español, es posible gracias a la suscripción realizada por el Ministerio de Sanidad y Consumo.

La página de entrada de la Biblioteca Cochrane nos muestra, en la columna de la izquierda que dispone de varias bases de datos en español y en inglés, como por ejemplo las revisiones Cochrane o la base de datos de la Fundación Kovacs para el dolor de espalda. Quizás, la más interesante para el clínico sea la de las revisiones Cochrane

Las revisiones Cochrane se basan mayoritariamente en ensayos clínicos controlados y son altamente estructuradas y sistematizadas. La evidencia se incluye o excluye en función de criterios explícitos de calidad, para minimizar los sesgos

La Base de Datos Cochrane de Revisiones Sistemáticas (BDCRS) contiene el texto completo de las revisiones sistemáticas publicadas. Esto quiere decir que cada documento contiene una gran cantidad de palabras. Por tanto, realizar una búsqueda con palabras muy comunes (por ejemplo, "cáncer", "aspirina"), sin otra restricción, localizará un gran número de documentos en donde la palabra buscada no tiene especial relevancia

No vamos a desarrollar la metodología de búsqueda en Cochrane por ser muy similar a la de Pubmed. Además, ya desde la primera página, se puede acceder a instrucciones detalladas en español de como utilizar Cochrane

Veamos como funciona Cochrane: para ello, introducimos el término del que deseamos obtener información, por ejemplo "atorvastatina" (obsérvese que hemos introducido este término en español). El sistema nos dice que dispone de 24 documentos, de los cuales 4 están en la base de datos de Revisiones sistemáticas, 1 en Bandolera, 8 en gestión Clínica y Sanitaria, etc. Para ver las revisiones ticamos la caja correspondiente, con lo que el sistema nos muestra los títulos de las 4 revisiones. Veamos la primera: se trata de un amplio documento de revisión que permite ser impreso, o visualizado en PDF

 

GOOGLE ACADEMICO (Google Scholar)

Google Académico es una variante de Google que permite buscar bibliografía especializada de una manera sencilla. Desde su página de búsqueda, Google Scholar permite buscar en un gran número disciplinas y fuentes como, por ejemplo, estudios revisados por especialistas, tesis, libros, resúmenes y artículos de fuentes como editoriales académicas, sociedades profesionales, depósitos de impresiones preliminares, universidades y otras organizaciones académicas.

Tampoco vamos a estudiar en profundidad como funciona Google Scholar ya que es similar a otros buscadores y, además, tiene detalladas instrucciones en español.

Sin embargo, Google scholar es menos especifico que otras herramientas y suministra todos los documentos en los que está incluído el término buscado, tanto en el título, como el abstracto, texto o referencias.

Vamos a ilustrar esta falta de expecificidad vamos a comparar los resultados que suministra Pubmed y Google Scholar, respectivamente. Voy a utilizar como término de búsqueda el término Oxodipina (en sus versiones española e inglesa), un antagonista del calcio en cuyo desarrollo tuve la ocasión de intervenir.

En Pubmed, Oxodipina no suministra ningún resultados aunque el sistema busca en la palabra ortográficamente similar Oxodiopine suministrando 40 resultados. En Google Scholar, Oxodipina arroja 6 resultados, mientras que Oxodipine nos dá 243 respuestas

Incluso si hacemos una búsqueda avanzada, por ejemplo Oxodipine AND hypertension en PUBMED y oxodipine hypertension en Google (Obsérvese que por defecto Google académico introduce la boleana AND), tenemos los siguientes resultados

Pubmed: 2 referencias
Google académico: 82 referencias

 

SCIRUS

Scirus se autocalifica como la base de datos de información científica más extensa del mundo con más 450 millones de items indexados. Permite a los científicos buscar no solo los contenidos de la revistas, sino tambien las "Home Pages" científicas, cursos, patentes y otras informaciones.

Lo mismo que el Google académico, una búsqueda en Scirus arroja muchos mas resultados que PubMed. (por ejemplo, elgodipine, 18 referencias en Pubmed y 607 en Scirus). Si repasamos los resultados de Scirus para elgodipina, comprobamos muchas redundancias (p.ej. resultado 9 y 10).

Como otras bases de datos, Scirus permite hacer busquedas avanzadas, seleccionar citas, enviar por correo electrónico o al portapapeles, etc

 

Referencias

  • Ref.1: Cardiology on Line: : http://www.cardiologyonline.com/journals.htm
  • Ref. 2. Amazon.com: Cardiology Books: http://www.amazon.com/s/ref=nb_ss_b/102-1296721-3524112?url=search-alias%3Dstripbooks&field-keywords=Cardiology&x=16&y=22Ref.3: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed
  • Ref.4. Guide to Library Research at Cornell: http://www.library.cornell.edu/olinuris/ref/research/tutorial.html
Monografía apta para discapacitados
Monografía creada el 15 de Septiembre de 2008. Equipo de Redacción de IQB
 
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